Microbiome
Métagénomique 16S
La composition microbienne, espèce par espèce.
Séquençage de l'ARN ribosomal 16S pour décrire la composition et la diversité des communautés microbiennes d'un échantillon.
8 à 12 jours ouvrés À partir de 2 900 MAD / échantillon
Présentation
Le séquençage 16S caractérise la diversité bactérienne d'un échantillon environnemental ou clinique. Il permet de comparer des groupes, de suivre une dysbiose ou d'évaluer l'effet d'un traitement.
L'analyse comprend le démultiplexage, le filtrage, le regroupement en unités taxonomiques (ASV/OTU), l'assignation taxonomique et les indices de diversité alpha et bêta.
Méthode & technologies
- Amplification V3–V4
- Séquençage MiSeq 2×300 pb
- DADA2 / QIIME2
- Assignation SILVA
Livrables
- Table d'abondance des ASV
- Analyse de diversité alpha/bêta
- Figures PCoA et barplots
- Rapport PDF