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HMP Research Médecine de précision

Expression

Transcriptomique ARN-seq

Ce que le génome exprime, vraiment.

Séquençage de l'ARN messager pour le différentiel d'expression, les fusions et la caractérisation des profils transcriptionnels.

12 à 18 jours ouvrés À partir de 5 400 MAD / échantillon
Illustration — Transcriptomique ARN-seq

Présentation

L'ARN-seq mesure l'expression de tous les transcrits d'un échantillon. Il met en évidence les gènes différentiellement exprimés, les isoformes, les fusions de gènes et les signatures transcriptionnelles.

Nos analyses incluent le contrôle qualité des lectures, le comptage par transcrit, l'analyse différentielle et les enrichissements fonctionnels.

Méthode & technologies

  • ARN total ou polyA
  • Illumina paired-end
  • Quantification Salmon / DESeq2
  • Analyse d'enrichissement GO/KEGG

Livrables

  • Matrice d'expression normalisée
  • Liste des gènes différentiels
  • Figures et rapport PDF
  • Scripts reproductibles